Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALYREFQ86V81 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ALYREFQ86V81 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms