Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMC1Q7Z7K0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms