Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms