Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPOCD1Q6ZMY3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms