Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms