Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC27A3Q5K4L6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC27A3Q5K4L6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC27A3Q5K4L6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC27A3Q5K4L6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC27A3Q5K4L6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC27A3Q5K4L6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC27A3Q5K4L6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms