Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RPL39P5Q59GN2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms