Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms