Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETM2Q2VYF4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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