Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSPP1Q1MSJ5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSPP1Q1MSJ5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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