Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
MSMPQ1L6U9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms