Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms