Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FXNQ16595 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FXNQ16595 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FXNQ16595 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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