Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTRK3Q16288 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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