Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CYTH1Q15438 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CYTH1Q15438 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CYTH1Q15438 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CYTH1Q15438 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CYTH1Q15438 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CYTH1Q15438 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CYTH1Q15438 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYTH1Q15438 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms