Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRKQ15262 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRKQ15262 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
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