Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NCAPHQ15003 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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