Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COL19A1Q14993 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms