Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM53BQ14153 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms