Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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ITGA9Q13797 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA9Q13797 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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