Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNA1SQ13698 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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