Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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