Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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