Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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TUBB3Q13509 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB3Q13509 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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