Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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