Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE3BQ13370 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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