Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CHAF1BQ13112 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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