Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFIAQ12857 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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