Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP160Q12769 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP160Q12769 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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