Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms