Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms