Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TGM3Q08188 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms