Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD51Q06609 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms