Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
REG3AQ06141 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
REG3AQ06141 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms