Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms