Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPN12Q05209 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms