Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms