Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APBA1Q02410 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms