Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRX1P78414 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms