Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YBX1P67809 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
YBX1P67809 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YBX1P67809 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms