Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2NP61088 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms