Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms