Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MTTPP55157 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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