Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FNTAP49354 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FNTAP49354 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FNTAP49354 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms