Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPD2P43304 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPD2P43304 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPD2P43304 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms