Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms