Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA2P42262 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms