Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms