Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN2P35609 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTN2P35609 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms