Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms